中医药与肠道微生态实验室，前身为医院中心实验室，于2021年正式成立，是医院“十四五”发展规划重要建设内容，2025年作为主要承担单位，成为闵行区中医药与肠道微生态协同创新实验室。实验室主任为复旦大学博士生导师王立顺研究员。现有固定科研人员6人，其中正高级1人、副高级1人、中级职称4人，在读博士后1人、博士研究生2人，形成了一支结构合理、梯队完整的科研团队。实验室已建成完善的肠道微生态与中医药研究平台，配备激光共聚焦显微镜、流式细胞仪、实时定量PCR系统、厌氧工作站、FMT粪便分析前处理仪等关键设备，建立了覆盖分子、细胞、动物模型及临床转化的系统研究体系。       近年来，实验室承担国家自然科学基金7项、省部级课题5项，获上海市医学科技奖2项。团队成员入选上海市科技启明星、上海市领军人才后备队、上海市青年科技英才扬帆计划、上海市卫健委优秀青年人才等多项人才计划。在《Nature Metabolism》《Nature Communications》《Gut Microbes》等国际权威期刊发表SCI论文40余篇，参与撰写英文专著1部，获授权国家专利8项。实验室与多个临床科室开展深度合作，共同建设生物样本库与疾病研究平台，积极推动基础研究与临床实践融合。目前，细胞房、模式动物平台等资源已向全院开放共享，为跨学科合作提供支撑。

实验室以“中医药与微生态医学协同创新”为宗旨，聚焦中药活性成分与肠道菌群互作机制，探索“中药‐菌群‐宿主”调控规律，致力于IBD、消化系统肿瘤及情志类疾病等难治性疾病的微生态指导中药治疗策略开发。重点发展中医药特色的FMT技术、活性物质筛选与活菌药物合成等关键技术，构建从基础到临床的完整研发体系。积极响应闵行区“国家中医药传承创新发展试验区”建设任务，作为主要承担单位，联合共建了“闵行区中医药与肠道微生态协同创新实验室”，积极推动中医药与微生态研究的临床转化与区域创新体系建设。